Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSTF3Q12996 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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