Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1DQ01668 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1DQ01668 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms