Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTCQ00610 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms