Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA9P57773 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA9P57773 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA9P57773 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms