Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRIM1P49642 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms