Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPFP49454 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPFP49454 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPFP49454 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPFP49454 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CENPFP49454 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPFP49454 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPFP49454 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPFP49454 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPFP49454 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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