Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTX3P26022 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms