Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC3P19447 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms