Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMP3P12645 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BMP3P12645 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP3P12645 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP3P12645 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms