Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PKHD1P08F94 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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