Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGAP02671 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGAP02671 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGAP02671 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGAP02671 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms