Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLSTN1O94985 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLSTN1O94985 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLSTN1O94985 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms