Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP10AO60312 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms