Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KIAA0556O60303 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms