Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTATSF1O43719 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms