Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLTPD2A6NH11 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms