Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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