Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EHD3Q9NZN3 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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