Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ZNF548Q8NEK5 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms