Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms