Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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