Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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