Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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SKIV2LQ15477 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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