Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CNGB1Q14028 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNGB1Q14028 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms