Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms