Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CUL4AQ13619 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL4AQ13619 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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