Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TCIRG1Q13488 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCIRG1Q13488 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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