Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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MKRN4PQ13434 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
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