Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP140Q13342 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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