Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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