Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms