Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-2B6SEH9 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-2B6SEH9 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms