Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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