Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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