Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HMGN3Q15651 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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