Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SS18Q15532 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SS18Q15532 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms