Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SSPNQ14714 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SSPNQ14714 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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