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| RUNX3 | Q13761 | FAM104B-204 | ENST00000472571 | 1109 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL293P-201 | ENST00000481765 | 281 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025459.1-201 | ENST00000504072 | 156 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P9-201 | ENST00000515039 | 680 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001978.1-201 | ENST00000526851 | 834 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001458.1-201 | ENST00000532626 | 92 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02258-201 | ENST00000551280 | 777 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TIMM9-203 | ENST00000555061 | 598 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNRHR2P1-201 | ENST00000555315 | 631 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012229.1-201 | ENST00000558699 | 499 nt | TSL 4 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD24P2-201 | ENST00000565486 | 219 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121834.1-201 | ENST00000572284 | 509 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ENPP3-202 | ENST00000358229 | 3026 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDST4-201 | ENST00000264363 | 3351 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE3A-202 | ENST00000397954 | 2873 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDE1A-202 | ENST00000358139 | 2015 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM111A-207 | ENST00000531147 | 3996 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASC19-284 | ENST00000642142 | 1868 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL2-211 | ENST00000370730 | 6173 nt | TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THOC2-202 | ENST00000355725 | 4930 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DMD-229 | ENST00000619831 | 13734 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRTM4-201 | ENST00000409088 | 3616 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEAT1-202 | ENST00000501122 | 22743 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF594-201 | ENST00000399604 | 4862 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAD17-203 | ENST00000345306 | 2789 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2W-207 | ENST00000602593 | 2201 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL6STP1-201 | ENST00000346911 | 1020 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | QKI-202 | ENST00000361195 | 1063 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP72-201 | ENST00000364442 | 117 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX30-204 | ENST00000376027 | 1106 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-925P-201 | ENST00000384629 | 104 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL17P50-201 | ENST00000396131 | 546 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02089-201 | ENST00000412360 | 682 nt | TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TATDN1P1-201 | ENST00000414123 | 891 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP46-201 | ENST00000448352 | 682 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM247-203 | ENST00000449601 | 741 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011196.1-201 | ENST00000451816 | 595 nt | TSL 2 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL32P14-201 | ENST00000463196 | 378 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC121161.1-201 | ENST00000510606 | 652 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097467.3-212 | ENST00000512269 | 568 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MEF2C-AS1-212 | ENST00000514158 | 713 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCP11X3P-202 | ENST00000514289 | 1254 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP18-201 | ENST00000520730 | 278 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP1-216 | ENST00000534497 | 825 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004217.2-201 | ENST00000547401 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027287.2-201 | ENST00000547559 | 592 nt | TSL 4 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC01081-201 | ENST00000597373 | 465 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100781.1-202 | ENST00000597906 | 463 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL159169.3-201 | ENST00000608871 | 561 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096577.2-201 | ENST00000611455 | 153 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7154-201 | ENST00000620673 | 73 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ASAH1-263 | ENST00000637872 | 886 nt | TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P12-201 | ENST00000414273 | 1543 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPR171-201 | ENST00000309180 | 1786 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157396.1-201 | ENST00000630034 | 8444 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF780B-202 | ENST00000434248 | 8665 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF780B-207 | ENST00000617676 | 8664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBA6-201 | ENST00000322244 | 9564 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKT3-201 | ENST00000263826 | 7081 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBBP6-203 | ENST00000381039 | 3384 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CUL4B-202 | ENST00000371322 | 4902 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01189-201 | ENST00000428440 | 3321 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFAP97-201 | ENST00000296775 | 903 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNASE2-201 | ENST00000304625 | 755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1005P-201 | ENST00000384519 | 107 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-17P-201 | ENST00000410290 | 190 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010385.1-201 | ENST00000412374 | 256 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XKRYP4-201 | ENST00000414395 | 483 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRR1P1-201 | ENST00000419430 | 803 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157387.1-201 | ENST00000436077 | 335 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01967-202 | ENST00000437506 | 515 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00376-201 | ENST00000439454 | 693 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP12-201 | ENST00000443616 | 753 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL096829.2-201 | ENST00000446582 | 742 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASP12-207 | ENST00000447913 | 819 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XKRYP5-201 | ENST00000449659 | 483 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX7A2-205 | ENST00000460985 | 357 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL5P30-201 | ENST00000465511 | 891 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLGLA-201 | ENST00000465668 | 449 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108941.1-201 | ENST00000502853 | 530 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096576.3-201 | ENST00000505528 | 721 nt | TSL 5 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049544.1-201 | ENST00000511849 | 673 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |