Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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RUNX3Q13761 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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RUNX3Q13761 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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RUNX3Q13761 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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RUNX3Q13761 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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RUNX3Q13761 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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