Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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