Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCGQ13326 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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