Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.7 ms