Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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