Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LMAN2Q12907 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms