Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms