Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECHS1P30084 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms