Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms