Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CTXN3Q4LDR2 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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