Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FXNQ16595 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms