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| FXN | Q16595 | RPS4XP14-201 | ENST00000493072 | 781 nt | BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | RN7SL362P-201 | ENST00000494228 | 267 nt | BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | AC104458.1-201 | ENST00000608243 | 463 nt | BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | BX664608.1-201 | ENST00000610519 | 487 nt | BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | PFKFB2-201 | ENST00000367079 | 3494 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | FANCD2-203 | ENST00000419585 | 5185 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | PNPLA4-203 | ENST00000444736 | 2752 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | LINC02203-203 | ENST00000625989 | 1600 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | ABCB5-202 | ENST00000404938 | 5811 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | DYNC1I2-225 | ENST00000508530 | 2494 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AP001029.2-203 | ENST00000589795 | 4910 nt | BASIC | 5.48 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | RBBP6-203 | ENST00000381039 | 3384 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | RYR3-209 | ENST00000634418 | 15078 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | WDR5B-201 | ENST00000330689 | 3720 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | LARS-201 | ENST00000274562 | 2213 nt | TSL 2 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF615-201 | ENST00000376716 | 4048 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | TENM1-202 | ENST00000422452 | 12891 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AC008033.1-201 | ENST00000216407 | 1162 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | PMCH-201 | ENST00000329406 | 766 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | WFDC8-202 | ENST00000357199 | 1268 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.234-201 | ENST00000364409 | 97 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.402-201 | ENST00000383972 | 102 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-1103P-201 | ENST00000384150 | 107 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AC099535.1-201 | ENST00000408928 | 371 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | AC016912.1-201 | ENST00000432241 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AC104850.1-201 | ENST00000435940 | 476 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | MTND6P18-201 | ENST00000439477 | 513 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AL161725.2-201 | ENST00000442442 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | AC113346.1-201 | ENST00000510150 | 287 nt | TSL 3 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AC105914.1-201 | ENST00000511798 | 226 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | PCAT4-202 | ENST00000514836 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | AL160191.1-201 | ENST00000555480 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FXN | Q16595 | AC243829.4-202 | ENST00000610845 | 410 nt | TSL 5 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AL596245.1-201 | ENST00000618994 | 362 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AL513314.2-204 | ENST00000619187 | 459 nt | TSL 5 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | AC111152.1-202 | ENST00000635848 | 339 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | NUP58P1-201 | ENST00000502546 | 1738 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | GNL2P1-201 | ENST00000451274 | 2190 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | MAP2-205 | ENST00000392194 | 5303 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | SCFD1-207 | ENST00000544052 | 2058 nt | TSL 2 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | PCLO-201 | ENST00000333891 | 20329 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | ANKRD46-204 | ENST00000519597 | 2779 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | TTC39C-201 | ENST00000304621 | 2304 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | ACTR3BP2-202 | ENST00000623630 | 1338 nt | BASIC | 5.47 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | TPTE2-201 | ENST00000255310 | 1562 nt | TSL 5 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | CALN1-204 | ENST00000405452 | 8571 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | ZFPM2-203 | ENST00000517361 | 3300 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | KLHL28-201 | ENST00000355081 | 2177 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.53 | | |
| FXN | Q16595 | SASS6-201 | ENST00000287482 | 3880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | PTPRZ1-201 | ENST00000393386 | 8175 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AC000123.3-201 | ENST00000624029 | 4975 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AC011155.1-201 | ENST00000316512 | 456 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |