Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms