Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
VAMP3Q15836 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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